El equipo de Sheppard llega a un planeta donde encuentran por la terquedad de rodney una especie de cristal similar al que Jack O'Neill encontró hace 10 años, Sheppard los despierta al tocarlos, y emanan una especie de rayo. Al llegar atlantis, primero teyla , luego la doctora y después ronon, y hasta el mayor lorne tienen pesadillas donde el mayor Sheppard tiene una presencia negativa. pero luego se torna peligroso, y hasta muere la psicóloga de atlantis, un importante miembro; por lo cual buscan a la entidad y descubren que está dentro de rodney, y Sheppard tendrá que ayudarlo a vencer a la entidad.