Con el cuerpo del Arsenal y el poder del Guantelete del Infinito en su poder, Ultron comienza su campaña criminal contra la humanidad al tomar el control de la tecnología de Industrias Hammer y AIM. Con el fin de liberar el Arsenal del control de Ultron, Iron Man trabaja en un malware destructor para desactivar a Ultron. Iron Man descubre que Ultron está en la base AIM usando su detector de Ultron, que él no comparte con su equipo. Más tarde él dice que era sospechoso y, por tanto, no compartía los detalles. Durante pelea con Ultron, Tony es capaz de inyectar a Ultron con el Destructor Malware con la ayuda de sus compañeros. De todos modos, él destruye sólo el 95% de Ultron ser emocional sobre el Arsenal y Ultron es capaz de reiniciar el sistema y derrotar a Tony. Esto enoja al Capitán América, como Tony no destruyó a Ultron como se explicó anteriormente por el equipo y arriesgado muchas vidas en la Tierra por sus emociones personales en el Arsenal. Al final, el Capitán América deja a los Vengadores después de una discusión con Tony.