L'idole de Donatello, le savant fou professeur Willard W. Willard, invente l'intensificateur moléculaire. Cette machine permet de contrôler la croissance des organismes vivants. Krang ordonne à Schredder de la récupérer. Au cours d'une démonstration, un dysfonctionnement de l'appareil répand sur le sol du laboratoire un flot de rayons ultraviolets qui influent aussitôt sur la végétation ambiante, transformant la ville en une véritable jungle...