Le pilote de la série, initialement diffusé sous forme de téléfilm de deux heures, est réédité sous la forme d'un épisode en deux parties de la série. Dans le premier épisode, un agent intelligent américain, un ami de McGarrett, est retrouvé mort sur une plage d'Honolulu. McGarrett, sachant que l'homme ne nageait pas, décide d'enquêter sur la mort comme un homicide. Five-O n'obtient aucune coopération de la part des fédéraux, ce qui rend McGarrett méfiant. Sa sonde mène finalement à un mystérieux navire, qui est à quai pour des réparations. Sous couverture en tant que membre d'une équipe de réparation, McGarrett découvre une chambre futuriste.