Les Autobots réalisent qu'une attaque contre le Maharaja n'était qu'une diversion des Décepticans pour laisser l'Arche sans protection. Les cassettes Décepticans s'introduisent dans l'Arche et parviennent à capturer Sparkplug en profitant de la confusion générale. Sparkplug est emmené dans la base sous-marine des Décepticans où on lui place une hypno-puce pour en faire un esclave obéïssant aveuglément. L'hypno-puce a été créée par le nouvel allié humain de Mégatron, le Dr Arkeville, dans le but de créer une armée d'esclaves humains pour construire un Pont Spatial géant beaucoup plus puissant qui pourrait placer Cybertron elle-même dans l'orbite de la Terre. L'énergie libérée de ce fait serait convertie en Energon et facilement transportée sur Cybertron. Sparkplug est secouru par les Autobots qui le ramènent à l'Arche sans savoir qu'il est sous le contrôle du Dr Arkeville. Les Autobots sont attaqués par les Décepticans qui pénêtrent dans l'Arche après que Sparkplug, hypnotisé, ait saboté Téletran 1. Spike réussit à réparer Téletran 1, ce qui oblige les Décepticans à s'échapper. Les Autobots trouvent la position du nouveau Pont Spatial et l'attaquent, mais Optimus Prime est forcé d'ouvrir le Pont ou bien Cybertron, déjà en approche, sera détruite. Alors que Cybertron traverse le Pont Spatial, le climat terrestre commence à devenir apocalyptique.