A quarta temporada se passa 18 meses após a terceira, e começa às 7h, em Los Angeles. Na trama, Bauer precisa salvar a vida do Secretário de Defesa e seu novo chefe, James Heller, e sua filha, Audrey Raines, com quem o agente tem um caso amoroso. Isso porque os dois foram sequestrados por terroristas que, em paralelo, lançam outros ataques sobre os Estados Unidos. Para contornar a situação, Bauer precisa usar métodos “não ortodoxos”, que têm consequências sobre ele e sobre o País.